隔離器內部的操作人要遵守基本的無菌操作。在隔離器中還需針對隔離器的特點注意以下問題：
　　1、隔離器中的動作不能幅度過大或動作過快。如快速的在隔離器中揮動手套，會造成隔離器內部壓力的很大波動。將手從隔離器手套中抽走會引起隔離器內部瞬時的負壓。
　　2、手套不能接觸任何與工藝操作無關的表面。
　　3、由微生物并經過隔離器操作培訓合格的人員操作無菌檢查隔離器。
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